新風系統的功能除了通風換氣以外，的功能就是過濾空氣中的污染物，因此新風系統的過濾網是整個系統中很為重要的一環。
根據等級、原理、材質，新風系統的濾網類型可以進行如下劃分：
按照過濾等級分
一般的新風系統過濾網可以分為三個層次，即初效過濾網、中效過濾網及高效過濾網。
1.初效過濾網：過濾室外大顆粒粉塵和蟲子等物質。
2.中效過濾網：過濾室外花粉等小顆粒物質。
3.高效過濾網：即HEPA，達到HEPA標準的過濾網。
可過濾絕大多數0.3微米以上的灰塵。不少新風系統自稱過濾效率99%以上，實際上是過濾數次后的檢測結果。而新風系統的PM2.5一次過濾效率即高達95%以上。大家在考察產品的過濾效果時，務必要擦亮眼睛。
在新風系統當中，初效、中效、高效過濾網一般不單獨使用，而是兩種或三種配合使用。裝配兩層以上濾網的新風系統，才能達到更好的空氣過濾效果。
